Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WIPF3A6NGB9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
WIPF3A6NGB9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WIPF3A6NGB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms