Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEMP2A6NFY4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms