Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00862A6NCI5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms