Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms