Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRGMA1A4Y4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRGMA1A4Y4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms