Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEB3A0JP26 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms