Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A0A087WUJ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A087WUJ7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms