Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC090044.1-201ENST00000423193 497 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL023773.1-201ENST00000423985 1124 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC011999.1-201ENST00000424794 1024 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FGL1-205ENST00000427924 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC00114-202ENST00000429621 827 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC002064.1-201ENST00000445784 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR2A7-201ENST00000493325 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC010307.2-202ENST00000502776 570 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC087633.1-201ENST00000554649 715 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC007785.3-201ENST00000595955 544 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SMARCE1P7-201ENST00000605515 485 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC007450.2-201ENST00000614160 290 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MIR6776-201ENST00000616678 59 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CAGE1-202ENST00000338150 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GNL2-201ENST00000373062 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GLULP5-201ENST00000547831 1390 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FAM19A1-203ENST00000496687 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 HSPD1P10-201ENST00000404829 1676 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL049840.1-201ENST00000498989 1404 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 INHBA-AS1-201ENST00000415848 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 VPREB1-201ENST00000302273 626 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AP000769.1-204ENST00000309775 800 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR1J2-201ENST00000335302 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC00970-201ENST00000366408 1129 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 DAB1-AS1-203ENST00000432897 656 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FBXO36-IT1-201ENST00000432957 582 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 WBP1LP7-201ENST00000437905 363 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SNX18P2-201ENST00000438540 808 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PCBP1-AS1-233ENST00000442326 668 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RPL34P1-201ENST00000450455 354 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC016700.3-201ENST00000455541 448 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC020718.1-201ENST00000456031 556 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 IAH1-205ENST00000482918 863 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC01341-205ENST00000509202 503 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LDHAL6DP-201ENST00000513668 693 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PRR13P2-201ENST00000533804 406 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC048383.1-201ENST00000558226 527 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CEACAM8-202ENST00000599005 544 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 RHAG-203ENST00000618248 1203 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.58-201ENST00000618720 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.132-201ENST00000619251 285 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AP003400.4-201ENST00000623832 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC01206-231ENST00000629026 858 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LIAS-210ENST00000638451 1159 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TMEM182-211ENST00000640575 1155 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PIWIL3-202ENST00000527701 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PLSCR4-210ENST00000493382 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 NLRP5-201ENST00000390649 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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