Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC019155.2-201ENST00000420224 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL357055.3-201ENST00000421157 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL135903.1-201ENST00000402742 1590 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 EFCAB10-205ENST00000486180 1550 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC01588-217ENST00000635379 1595 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 HSD17B7-201ENST00000254521 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 OR10J5-201ENST00000334857 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC016598.1-201ENST00000340585 560 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 CD1E-201ENST00000368154 435 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 FAM209A-201ENST00000371328 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PRH2-202ENST00000396400 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AL365214.1-201ENST00000404237 997 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PTGFRP43088 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 LRMP-205ENST00000548766 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 AZI2-202ENST00000334100 943 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 ITGB3BP-202ENST00000371092 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 MIR623-201ENST00000384986 98 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTGFRP43088 HMGN1P34-201ENST00000413023 290 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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