Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ABRAXAS1-201ENST00000321945 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 R3HDM2-207ENST00000441731 4076 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZNF565-201ENST00000304116 2023 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL731563.3-201ENST00000608005 3005 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ADH1C-204ENST00000515683 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL445250.1-204ENST00000641775 1723 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SYNPR-212ENST00000479198 2436 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC078795.1-201ENST00000602342 3143 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CNFN-201ENST00000222032 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 WISP3-201ENST00000230529 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CH17-340M24.3-201ENST00000360656 598 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SRSF10-206ENST00000374453 866 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 TRGVA-201ENST00000413819 285 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ATP5HP4-201ENST00000414313 475 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ACTG1P1-201ENST00000415794 1129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC022400.5-201ENST00000415917 1031 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL450304.1-201ENST00000418657 759 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC01105-202ENST00000431182 708 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL358976.1-201ENST00000437555 392 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AP006222.1-201ENST00000442116 1292 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RPL23P4-201ENST00000442836 416 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL353072.1-201ENST00000446021 442 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL355483.1-201ENST00000450469 237 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AL078599.2-201ENST00000457116 471 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 DNAJC9-AS1-202ENST00000457147 762 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL666P-201ENST00000460953 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 WWTR1-IT1-201ENST00000463167 451 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 APOA2-203ENST00000463812 401 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC016968.1-201ENST00000479610 697 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC011294.1-201ENST00000487094 844 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 IGLV3-29-201ENST00000520084 244 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC023232.1-201ENST00000524963 285 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CYP1A1-205ENST00000564596 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ALOX12-AS1-207ENST00000574377 886 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL716P-201ENST00000580539 268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZFP14-202ENST00000589280 642 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LAMTOR5-AS1-211ENST00000598350 749 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC018638.6-201ENST00000605007 1267 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC116050.1-201ENST00000609777 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 C5orf67-202ENST00000611197 354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL673P-201ENST00000616262 237 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC245505.3-201ENST00000616788 358 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL719P-201ENST00000620196 237 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PGM5P3-AS1-206ENST00000621255 877 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RN7SL469P-201ENST00000621501 237 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CR381653.1-205ENST00000623409 580 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CTBP1-219ENST00000629223 210 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC025268.1-201ENST00000632192 1199 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC01835-203ENST00000639800 567 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RDM1-229ENST00000639942 420 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LPA-202ENST00000447678 1839 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC01886-202ENST00000443205 1539 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SP110-215ENST00000540870 2032 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC012513.3-201ENST00000623250 2116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 CEACAM21-201ENST00000187608 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LINC01800-201ENST00000445865 1977 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 PLEKHA5-215ENST00000539256 3357 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RFX3-202ENST00000358730 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 KANSL2-201ENST00000420613 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 BTG4-201ENST00000356018 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 WTAPP1-201ENST00000371455 546 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LY6G6E-225ENST00000383418 383 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 EPSTI1-203ENST00000398762 957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 BRCC3-206ENST00000399042 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC108059.1-201ENST00000411629 725 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC073188.2-201ENST00000424036 701 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 HNRNPCP9-201ENST00000426952 859 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 TTC4P1-201ENST00000427137 1158 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 AC009501.2-201ENST00000428700 312 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTGFRP43088 GSG1-204ENST00000432710 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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