Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPRBQ9Y5M8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPRBQ9Y5M8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms