Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP12Q9Y561 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms