Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PLXND1Q9Y4D7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms