Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD3Q9Y3P4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms