Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL11Q9Y3B7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL11Q9Y3B7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms