Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZDHHC9Q9Y397 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZDHHC9Q9Y397 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms