Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DTX4Q9Y2E6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DTX4Q9Y2E6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms