Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC4Q9Y296 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms