Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVW-1Q9UQF0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVW-1Q9UQF0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms