Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF18Q9UNG2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms