Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNRGQ9UMZ2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms