Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP18Q9UMW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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