Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MED23Q9ULK4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms