Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS11EQ9UL52 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMPRSS11EQ9UL52 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms