Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO4Q9UKT5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FBXO4Q9UKT5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms