Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHIC2Q9UKJ5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHIC2Q9UKJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms