Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUF60Q9UHX1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms