Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFMBT1Q9UHJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms