Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCSK1NQ9UHG2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms