Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT172Q9UG01 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IFT172Q9UG01 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms