Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VTI1BQ9UEU0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VTI1BQ9UEU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms