Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EXTL2Q9UBQ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms