Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC6Q9UBN7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC6Q9UBN7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms