Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPG2Q9UBF2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPG2Q9UBF2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms