Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLKQ9UBE8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms