Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL13Q9P2N7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL13Q9P2N7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms