Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHPF2Q9P2E5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHPF2Q9P2E5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms