Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP36Q9P275 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP36Q9P275 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms