Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMG20BQ9P0W2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms