Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMCD1Q9NZU5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms