Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PODXL2Q9NZ53 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PODXL2Q9NZ53 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms