Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKIRAS2Q9NYR9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms