Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNK4Q9NYG8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNK4Q9NYG8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms