Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms