Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM53CQ9NYF3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FAM53CQ9NYF3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FAM53CQ9NYF3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FAM53CQ9NYF3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FAM53CQ9NYF3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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FAM53CQ9NYF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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FAM53CQ9NYF3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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FAM53CQ9NYF3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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FAM53CQ9NYF3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM53CQ9NYF3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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