Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC5A4Q9NY91 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC5A4Q9NY91 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC5A4Q9NY91 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms