Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCM9Q9NXL9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM9Q9NXL9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms