Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM30AQ9NV96 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms