Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOMER3Q9NSC5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOMER3Q9NSC5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms