Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX15Q9NRS6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNX15Q9NRS6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms